Lähi-infrapuna ja kaukoinfrapuna eivät ole keskenään vaihdettavissa. Lähi-infrapuna tunkeutuu syvemmälle kudokseen ja sitä käytetään yleisesti fotobiomodulaatioon, kun taas kaukoinfrapuna absorboituu ihon pinnan lähelle ja tuottaa pääasiassa lämpöä. Valinta niiden välillä riippuu siitä, onko tavoitteena soluvalohoito vai lämpöaltistus.