La luminothérapie rouge présente généralement un faible risque lorsqu'elle est utilisée correctement, mais sa sécurité dépend de la dose, de la distance, de la protection oculaire, de l'état de santé de l'utilisateur et de la qualité de l'appareil. Les principaux risques sont l'exposition directe des yeux, une irradiance excessive, la photosensibilité, une documentation insuffisante et une utilisation inappropriée en présence de certaines pathologies.