Rødlysterapi er generelt lavrisiko når den brukes riktig, men sikkerheten avhenger av dose, avstand, øyevern, brukertilstand og enhetens kvalitet. De viktigste risikoene inkluderer direkte øyeeksponering, overdreven bestråling, lysfølsomhet, dårlig dokumentasjon og usikker bruk rundt visse medisinske tilstander.