Die Rotlichttherapie ist bei korrekter Anwendung im Allgemeinen risikoarm. Die Sicherheit hängt jedoch von der Dosis, dem Abstand, dem Augenschutz, dem Gesundheitszustand des Anwenders und der Gerätequalität ab. Zu den Hauptrisiken zählen direkte Augenbestrahlung, zu hohe Bestrahlungsstärke, Photosensibilisierung, mangelhafte Dokumentation und unsachgemäße Anwendung im Zusammenhang mit bestimmten Erkrankungen.