Nabij-infrarood en ver-infrarood zijn niet uitwisselbaar. NIR dringt dieper door in weefsel en wordt vaak gebruikt voor fotobiomodulatie, terwijl FIR vlak onder het huidoppervlak wordt geabsorbeerd en voornamelijk warmte produceert. De keuze tussen beide hangt af van het doel: cellulaire lichttherapie of thermische blootstelling.